研究紹介



X線結晶構造解析関連ソフトウェア関連


研究業績

2010年 | 2009年 | 2007年 | 2006年 | 2005年 | 2004年 | 2003年 | 2002年 | 2000年 | 1999年

2010年

A structural determinant for the control of PIP2 sensitivity in G protein-gated inward rectifier K+ channels
Atsushi Inanobe, Atsushi Nakagawa, Takanori Matsuura, Yoshitaka Kurachi
Journal of Biological Chemistry 285(49), 38517-38523 (2010)
abstract
緑膿菌由来多剤排出トランスポーター, MexBの高分解能X線結晶構造解
米原 涼, 山下 栄樹, 原田 健一, 佐藤 尚紀, 松浦 孝範, 鈴木 守, 村上 聡, 中江 太治, 中川 敦史
日本結晶学会 2010年度年会 (大阪, 2007.12.3-5)
緑膿菌由来の多剤排出トランスポーターサブユニットMexAの全体構造解析への試み
原田 健一, 米原 涼, 松浦 孝範, 山下 栄樹, 鈴木 守, 中江 太治, 中川 敦史
日本結晶学会 2010年度年会 (大阪, 2007.12.3-5)
The wwPDB Common Annotation and Deposition Tool Development
John Westbrook, Martha Quesada, Jasmine Young, Zukang Feng, Tom Oldfield, Sameer Velankar, Jawahar Swaminathan, Takanori Matsuura, Eldon Ulrich, Steve Madding, Gerard Kleywegt, Haruki Nakamura, John Markley, Helen Berman
2010 Annual Meeting of American Crystallographic Association (Chicago, Illinois, USA, 2010.7.24 - 2010.7.29)
abstract
緑膿菌の多剤排出ポンプ、MexA-OprM複合体のX線結晶構造解析への試み
米原 涼, 山下 栄樹, 原田 健一, 佐藤 尚紀, 松浦 孝範, 鈴木 守, 村上 聡, 中江 太治, 中川 敦史
第10回 日本蛋白質科学会年会 (熊本, 2010.6.16-18)
abstract

2009年

Deposition of NMR structures of small biomolecules and their data to database PDBj-BMRB
Eiichi Nakatani, Takanori Matsuura, Steven Mading, Yoko Harano, Naohiro Kobayashi, Eldon. L. Ulrich, John L. Markley, Hideo Akutsu, Haruki Nakamura, Toshimichi Fujiwara
The 3rd Asia-Pacific NMR Symposium (Jeju, Korea, 2009.10.25 - 2009.10.28)
abstract
緑膿菌多剤排出トランスポーターサブユニットMexAのdisordered domainの結晶構造解析への試み
原田 健一, 松浦 孝範, 山下 栄樹, 鈴木 守, 中江 太治, 中川 敦史
第9回 日本蛋白質科学会年会 (熊本, 2009.5.20-22)
abstract
Data Deposition and Annotation at the Worldwide Protein Data Bank
Shuchismita Dutta, Kyle Burkhardt, Jasmine Young, Ganesh J. Swaminathan, Takanori Matsuura, Kim Henrick, Haruki Nakamura and Helen M. Berman
Mol. Biotechnol., 42(1), 1-13 (2009)
abstract

2007年

wwPDB Remediation Projectの概要とPDBjの現状
松浦 孝範, 中川 敦史, 中村 春木
日本結晶学会 2007年度年会 (東京, 2007.12.1-2)
要旨
High-resolution Crystal Structure of β2-Microglobulin Formed at pH 7.0
Kentaro Iwata, Takanori Matsuura, Kazumasa Sakurai, Atsushi Nakagawa, and Yuji Goto
J. Biochem. 142(3), 413-419 (2007)
abstract
Structural Diversity in the Cytoplasmic Region of G Protein-Gated Inward Rectifier K+ Channels
Atsushi Inanobe, Takanori Matsuura, Atsushi Nakagawa, Yoshihisa Kudachi
Channels 1(1), 39-45 (2007)
abstract
The First Crystal Structure of L-Threonine Dehydrogenase
Kazuhiko Ishikawa, Noriko Higashi, Tsutomu Nakamura, Takanori Matsuura, and Atsushi Nakagawa
Journal of Molecular Biology 336(3), 857-867 (2007)
abstract

2006年

Atomic structure of the MexAB-OprM multidrug Efflux Pump from Pseudomonas aeruginosa
Atsushi Nakagawa, Takanori Matsuura, Hiroyuki Akama, Kenichi Harada, Taiji Nakae
The 5th East Asian Biophysics Symposium & the 44th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
abstract
Conformation of Amyloid Fibrils of β2-Microglobulin Probed by Tryptophan Mutagenesis
Miho Kihara, Eri Chatani, Kentaro Iwata, Kaori Yamamoto, Takanori Matsuura, Atsushi Nakagawa, Hironobu Naiki, Yuji Goto
J. Biol. Chem. 281(41), 31061-31069 (2006)
abstract
The accurate structure of the chitin-binding domain of chitinase A1 from Bacillus circulans WL-12
Takanori Matsuura, Ken-ichi Akagi, Jun Watanabe, Yuko Nagasaki, Masashi Hara, Eriko Chikaishi, Izumi Yabuta, Tohru Yamaguchi, Hideo Akutsu, Atsushi Nakagawa, Takeshi Watanabe, Takahisa Ikegami
International Symposium on Industrial Enzymes (Osaka, Japan, 2006.2.15-16)
abstract

2005年

緑膿菌薬物排出蛋白質群の立体構造解析 (Crystal Structure of Multi-Drug Efflux Transporter Subunits, MexA and OprM, of Pseudomonas aeruginosa)
Hiroyuki AKAMA, Taiji NAKAE, Takanori MATSUURA and Atsushi NAKAGAWA
J. Cryst. Soc. Jpn., 47(6), 396-402 (2005)
abstract
Monte Carlo Search with Many CPUs: Application to 6 dim. Molecular Replacement
Masato Yoshimura, Aki Nagata, Takanori Matsuura, Youhei Kondou, Atsushi Nakagawa, Tomitake Tsukihara
XX Congress of the International Union of Crystallography (Florence, Italy, 2005.8.23-31)
abstract
Crystal structure of chitin binding domain of chitinase A1
Takanori Matsuura, Izumi Yabuta, Tohru Yamaguch, Eriko Chikaishi, Yuko Nagasaki, Masashi Hara, Takeshi Watanabe, Kenichi Akagi, Hideo Akutsu, Takahisa Ikegami and Atsushi Nakagawa
XX Congress of the International Union of Crystallography (Florence, Italy, 2005.8.23-31)
abstract
Crystallization and preliminary X-ray analysis of hyperthermophilic L-threonine dehydrogenase from the archaeon Pyrococcus horikoshii
Noriko Higashi, Takanori Matsuura, Atsushi Nakagawa and Kazuhiko Ishikawa
Acta Cryst. F61(4), 432-434 (2005)
abstract
薬剤排出ポンプのサブユニットMexAの結晶構造解析とその意義
赤間 浩之, 松浦 孝範, 月原 冨武, 中川 敦史, 中江 太治
PFシンポジウム (つくば, 2005.3.17-18)
要旨
A solubility and B-factor minimum of hen egg-white lysozyme crystals at 0.5 M concentration NiCl2
Shu Jie Li, Takanori Matsuura, Hideaki Tanaka, Atsushi Nakagawa, Tomitake Tsukihara and Mitsuo Ataka
Journal of Crystal Growth 276(1-2), 222-229 (2005)
abstract
Crystallization and preliminary X-ray crystallographic study of disproportionating enzyme from potato
Kayo Imamura, Takanori Matsuura, Zhengmao Ye, Takeshi Takaha, Kazutoshi Fujii, Masami Kusunoki and Yasunori Nitta
Acta Cryst. F61(1), 109-111 (2005)
abstract

2004年

ジャガイモ不均化酵素・アカボース複合体の結晶解析
今村 香代, 松浦 孝範, Zhengmao Ye, 高羽 武史, 藤井 和俊, 楠木 正巳, 新田 康則
日本結晶学会 2004年度年会, (大阪, 2004.11.16-17)
要旨
緑膿菌の抗生物質排出ポンプの構造と機能
中江 太治, 赤間 浩之, 松浦 孝範, 月原 冨武, 中川 敦史
日本結晶学会 2004年度年会, (大阪, 2004.11.16-17)
モンテカルロ法による分子置換6次元探索
吉村 政人, 永田 明希, 松浦 孝範, 近藤 洋平, 中川 敦史, 月原 冨武
日本結晶学会 2004年度年会, (大阪, 2004.11.16-17)
要旨
Crystal Structure of OprM and MexA of the Multidrug Efflux pump from Pseudomonas aeruginosa
Atsushi Nakagawa, Hiroyuki Akama, Takanori Matsuura, Tomitake Tsukihara, and Taiji Nakae
The 77th Annual Meeting of the Japanese Biochemical Society (Yokohama Japan, 2004.10.13-16)
Abstract
Purification, characterization of novel 2-keto-D-galactonic acid reductase (KGAR) from P. fluorescens.
Ritsuko Tinimura, Rie Nomoto, Harumi Hosaka, Takanori Matsuura, Atsushi Nakagawa, Kenji Ikehara,Ryoko Iwamoto
The 77th Annual Meeting of the Japanese Biochemical Society (Yokohama Japan, 2004.10.13-16)
Abstract
The crystal structure of the chitin binding domain of chitinase A1 from Bacillus circulans WL-12
Takanori Matsuura, Izumi Yabuta, Eriko Chikaishi, Yuko Nagasaki, Masashi Hara, Takeshi Watanabe, Kenichi Akagi, Hideo Akutsu, Takahisa Ikegami, Atsushi Nakagawa
BSR2004 (Himeji, Japan, 2004.9.7-11)
abstract
Crystal structure of Disproportionating Enzyme from Potato at 2.0 Å resolution
Kayo Imamura, Takanori Matsuura, Zhengmao Ye, Takeshi Takaha, Kazutoshi Fujii, Masami Kusunoki and Yasunori Nitta
BSR2004 (Himeji, Japan, 2004.9.7-11)
abstract
Crystal structure of the membrane-fusion protein of the multidrug efflux pump
Takanori Matsuura, Hiroaki Akama, Tomitake Tsukihara, Atsushi Nakagawa, Taiji Nakae
BSR2004 (Himeji, Japan, 2004.9.7-11)
abstract
Crystal Structure of OprM and MexA of the Multidrug Efflux pump from Pseudomonas aeruginosa
Atsushi Nakagawa, Hiroyuki Akama, Takanori Matsuura, Tomitake Tsukihara, and Taiji Nakae
BSR2004 (Himeji, Japan, 2004.9.7-11)
abstract
Crystal structure of the membrane-fusion protein of the multidrug efflux pump
Takanori Matsuura, Hiroaki Akama, Tomitake Tsukihara, Atsushi Nakagawa, Taiji Nakae
Gordon Research Conference on Bacterial Cell Surfaces (New London, USA, 2004.6.27-7.2)
abstract
Crystal Structure of the Membrane Fusion Protein, MexA, of the Multidrug Transporter in Pseudomonas aeruginosa
Hiroyuki Akama, Takanori Matsuura, Sachiko Kashiwagi, Hiroshi Yoneyama, Shin-ichiro Narita, Tomitake Tsukihara, Atsushi Nakagawa, and Taiji Nakae
J. Biol. Chem. 279(25), 25939-25942 (2004)
abstract

2003年

Crystal structure of a lysine biosynthesis enzyme, LysX, from Thermus thermophilus HB8
Hiroaki Sakai, Marina N. Vassylyeva, Takanori Matsuura, Shun-ichi Sekine, Kazumi Gotoh, Makoto Nishiyama, Takaho Terada, Mikako Shirouzu, Seiki Kuramitsu, Dmitry G. Vassylyev and Shigeyuki Yokoyama
J. Mol. Biol. 332(3), 729-740 (2003)
abstract
Cloning, expression, purification, crystallization and initial crystallographic analysis of the lysine-biosynthesis LysX protein from Thermus thermophilus HB8
Marina N. Vassylyevaa, Hiroaki Sakai, Takanori Matsuura, Shun-ichi Sekine, Makoto Nishiyama, Takaho TeRada, Mikako Shirouzu, Seiki Kuramitsu, Dmitry G. Vassylyev and Shigeyuki Yokoyama
Acta Cryst. D59(9), 1651-1652 (2003)
abstract
配隅体型自家不和合性における自他認識機構のシミュレーション解析
井田 孝, 橋本 博, 清水 敏行, 佐藤 衛, 松浦 孝範, 乗岡 茂巳, 崎山 文夫
第3回 日本蛋白質科学会年会 (札幌, 2003.6.23-25)
要旨

2002年

Crystal structure analysis of S6 modification protein homologue from Thermus thermophilus HB8
Hiroaki Sakai, Marina N. Vassylyeva, Takanori Matsuura, Shun-ichi Sekine, Takaho Terada, Mikako Shirouzu, Seiki Kuramitsu, Shibata, T., Dmitry G. Vassylyev, Shigeyuki Yokoyama
ISGO International Conference on Structural Genomics 2002 (Berlin, Germany, 2002.10.10-13)
abstract
配隅体型自家不和合性因子S-RNaseの種特異的立体構造
乗岡 茂巳, 松浦 孝範, 酒井 宏明, 井田 孝, 崎山 文夫, 佐藤 衛
第2回 日本蛋白質科学会年会 (名古屋, 2002.6.13-15)
要旨
配偶体型自家不和合性因子ニホンナシS3-RNaseのX線結晶構造解析 (Crystal structure analysis of Japanese pear S3-RNase responsible for gametophytic self-incompatibility)
松浦 孝範
大阪大学大学院 理学研究科 博士論文 (2002)

2001年

Crystal Structure at 1.5-Å Resolution of Pyrus pyrifolia Pistil Ribonuclease Responsible for Gametophytic Self-incompatibility
Takanori Matsuura, Hiroaki Sakai, Masaki Unno, Koh Ida, Mamoru Sato, Fumio Sakiyama, and Shigemi Norioka
J. Biol. Chem. 276(48), 45261-45269 (2001)
abstract
自家不和合性因子S-RNaseによる花粉リボソーム分解活性の解析
瀬崎 浩史, 松浦 孝範, GAMAGE Niranjali, 乗岡 尚子, 乗岡 茂巳
第74回 日本生化学会大会 (京都, 2001.10.25-28)
要旨
Molecular Cloning of cDNAs Encoding S-RNsaes-like Proteins from Self-incompatible Chinese pear 'Ya-Li' and Its Comaptible Mutant 'Kintsui li'
Naoko Norioka, Satoko Okuhata, Takanori Matsuura, S.L. Li, Hidehira Tabira, Kosuke Inoue, Fumio Sakiyama and Shigemi Norioka
International Symposium on Asian Pears (Tottori, Japan, 2001.8.25-29)
abstract
バラ科配偶体型自家不和合性因子S3-RNaseの1.5Å分解能X線結晶構造解析
松浦 孝範, 酒井 宏明, 海野 昌喜, 崎山 文夫, 乗岡 茂巳
第1回 日本蛋白質科学会年会 (大阪, 2001.6.1-3)
要旨
Purification and crystallization of Japanese pear S-RNase associated with gametophytic self-incompatibility
Takanori Matsuura, Masaki Unno, Hiroaki Sakai, Tomitake Tsukihara and Shigemi Norioka
Acta Cryst. D57(1), 172-173 (2001)
abstract

2000年

Expression of a fusion protein of Pyrus pyrifolia S-RNase with glutathione-S-transferase in E. coli
Niranjali Gamage, Takanori Matsuura, Naoko Norioka, Yumi Yoshimura, Takeshi Takasaki, Tetsu Nakanishi, Shigemi Norioka
Biotechnol. Lett. 22(17), 1413-1417 (2000)
abstract

1999年

自家不和合性因子S-RNaseの大腸菌における発現系の構築
GAMAGE Niranjali, 松浦 孝範, 乗岡 尚子, 吉村 由美, 中西 テツ, 乗岡 茂巳
第72回 日本生化学会大会 (横浜, 1999.10.6-9)
要旨
中国ナシ「キンツイリー」における自家不和合性の分子的解析
松浦 孝範, 乗岡 尚子, 奥畑 聡子, 石水 毅, 吉村 由美, 李 紹良, 下中 雅仁, 井上 耕介, 崎山 文夫, 乗岡 茂巳
第72回 日本生化学会大会 (横浜, 1999.10.6-9)
要旨
Expression system of Pyrus pyrifolia S-RNase in E. coli and its application to screening of pollen S-gene product(s)
Gamage, N., Matsuura, T., Norioka, N., Yoshimura, Y., Nakanishi, T., Norioka, S.
International Conference on Pollen-Stigma Interactions (Oxford, United Kingdom, 1999.7.18-21)
abstract
中国ナシ「キンツイリー」における自家不和合性の分子的解析
松浦 孝範
大阪大学大学院 理学研究科 修士論文 (1999)

執筆

立体構造解析のためのソフトウェア
松浦孝範, 中川敦史
バイオ高性能機器・新技術利用マニュアル, 蛋白質・核酸・酵素 49(11), 1821-1827 (2004)
出版社ページ


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松浦 孝範 (MATSUURA Takanori)
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